Το Ευρετήριο όρων της ΜΟΔ περιέχει τους όρους που εισήγαγαν οι νέοι θεσμοί και μηχανισμοί της προγραμματικής περιόδου 2007-2013. Με στόχο τη σωστή ενημέρωση και πληροφόρηση, το Ευρετήριο επεξηγεί τη σχετική ορολογία στο ευρύτερο κοινό και στους αρμόδιους φορείς. Η ορολογία που περιέχει αναφέρεται σε: 
- 
Διαχείριση - Παρακολούθηση - Αξιολόγηση Προγραμμάτων 
- Διαδικασίες υλοποίησης έργων 
- Διάρθρωση της Εθνικής Κεντρικής και Περιφερειακής Διοίκησης 
- Θεσμικά Όργανα της Ευρωπαϊκής Ένωσης και Υπηρεσίες της Ευρωπαϊκής Επιτροπής 
- Χρηματοοικονομικούς όρους